Říčka pramení jižně od Velké Bíteše, její tok je orientován jižním směrem a u Senohradského mlýna pod Ketkovicemi se vlévá zleva do Oslavy. Velikost povodí je pouhých 64 km2, délka sjížděného toku 12 km.

Z rozlohy povodí vyplývá, že Chvojnice je velmi malá říčka. Teče pěkným lesnatým údolím, má poměrně velký spád a na mnoha místech tvoří peřeje. Plavba je však značně obtížná pro množství nízkých lávek a stromů přes řeku. Na Chvojnici byla v posledních letech vybudována závlahová nádrž, čímž tok nad nádrží ztratil pro vodáky význam.